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PPMseq-2 病原微生物测序数据分析软件

商品品牌: 国产

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PPMseq-2 病原微生物测序数据分析软件


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PPMseq-2 病原微生物测序数据分析软件是***款专门用于病原微生物测序数据分析的软件。它可以帮助研究人员从测序数据中识别和分析病原微生物的种类和数量,从而辅助诊断和治疗。


该软件通常具有以下功能:


数据导入:支持多种测序数据格式的导入,如FASTQ、FASTA等。

质量控制:对导入的测序数据进行质量控制,去除低质量序列和可能的污染序列。

序列比对:将高质量的测序数据与已知的病原微生物基因组数据库进行比对,识别出可能的病原微生物。

物种鉴定:基于比对结果,鉴定出样本中存在的病原微生物种类,并提供详细的分类信息。

功能分析:除了物种鉴定外,还可以对病原微生物的功能基因进行分析,了解其可能的致病机制和抗药性等特性。

报告生成:自动生成详细的分析报告,包括样本中病原微生物的种类、数量、功能分析结果等。

PPMseq-2 软件通常适用于临床微生物检测、流行病学研究、环境微生物监测等领域。通过高效的算法和强大的数据库支持,PPMseq-2 可以快速准确地分析大量测序数据,帮助研究人员更好地理解病原微生物的特性和传播途径。


产品名称

病原微生物测序数据分析软件

管理类别

第二类

型号规格

PPMseq-2。

结构及组成/主要组成成分

产品的逻辑组成由用户中心、数据库、样本分析、统计模块、报告管理组成。产品的物理组成由 U 盘组成。软件发布版本号为 V1。

适用范围/预期用途

与适用的测序试剂盒配套使用,通过对临床样本(比如痰液、肺泡灌洗液、血浆、脑脊液等)的全部 DNA 测序数据进行计算,可检测基因组序列已知 的可疑致病微生物,检测范围包括已知 157 种临床重要致病细菌、支原体、衣原体、立克次氏体、螺旋体及 28 种临床重要致病病毒,获得与之对应的参考序列比对结果,从而鉴定样本中存在的可疑致病微生物。不包含自动诊断功能。


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